故事設於1992年，也是《X戰警：天啟》的十年之後，由X教授所率領的X戰警，此時則已被視為國家英雄。贏得了這個全新地位之後，他們也因此踏上了一場外太空救援任務；此時太陽閃燄意外擊中X太空梭，也讓琴·葛蕾無意間獲得了一種「不懷好意並渴望力量的全新能量」。在逐漸化身為能力強大的黑鳳凰之同時，她也隨之陷入了一場身份認同危機。